Normaalisti akvaarion vesi haisee, jos ylipäätään haisee "vedelle" tai kasveille tms. Parhaiten hajua voi tutkailla pyyhkäisemällä akvaarion etulasia puhtaalla kankaan pasella. Siitä voi sitten haistaa vettä. Hajun ollessa voimakas, sen tuntee kyllä kun avaa akvaarion kannen.

Pistävä haju
Sinilevät eli syanobakteerit, jotka muodostavat sinivihreän keton useimmiten pohjallem utta myös kasvien pinnoille haisevat yleensä pistävän väkevälle. Sinilevät ovat merkkinä korkeasta nitriitti, nitraatti tai fosfaattipitoiusuuksista. Hoitona tiheämmät vedenvaihtovälit.

Mädäntyneen kananmunan haju
Pohjan "mentyä tukkoon", jolloin sinne syntyy hapeton tila, alkaa mätäneminen. Tällöin rikkipitoiset yhdisteet muodostavat rikkivetyä, joka nousee kuplina pinnalle ja aiheuttaa mädäntyneen kananmunan hajua. Hoitokeinona auttaa pohjamateriaalin pöyhiminen vedenvaihtojen yhteydessä.

Haiseva vesi
Vesibakteerien normaaliin hajotustoimintaan vaikuttaa ratkaisevasti veden happipitoisuus ja Redox-potentiaali.